Gennem Innovationsagentordningen tilbyder Alexandra Instituttet danske SMV'er et innovationstjek. Ordningen hører under Forsknings- og Innovationsstyrelsen, og er pr. 1/7 2010 blevet national. Det betyder, at alle landets SMV'er nu har mulighed for at få gennemført et innovationstjek.

Alexandra Instituttet er sammen med de 8 andre Godkendte Teknologiske Serviceinstitutter (GTS) operatør på ordningen, og har innovationsagenter, der gennemfører innovationstjek.

Innovationsstjekket tager udgangspunkt i de specifikke behov og realiteter i virksomhederne med det formål at skabe værdi og vækst for virksomhederne gennem innovation.  

Gennem et innovationstjek i virksomheden identificerer innovationsagenten mulige innovations- og udviklingsindsater. Indsatserne kan fx være relateret til teknologier, produkt- og serviceudvikling, arbejdsprocesser og forretningsstrategier. Det væsentligste er, at indsatserne passer til virksomhedens behov, ambitioner og ønsker. Herefter kan agenter hjælpe virksomheden i de indledende faser af et evt. udviklingsprojekt, fx med kontaktskabelse til relevante samarbejdspartnere, samt nationale og internationale ordninger, der kan støtte op om det konkret innovationsforløb i virksomheden.